Kahden vuoden välein järjestettävä liittokokous päättää Vasemmistonuorten toiminnan suurista linjoista ja poliittisesta ohjelmasta sekä valitsee puheenjohtajiston ja hallituksen. Liittokokouksessa päätöksiä tekevät piirijärjestöjen valitsemat 200 vasemmistonuorta.

Viimeisin liittokokous pidettiin 19.–21.5.2017 Kuopiossa. Seuraava kokous on 1.-3.11.2019 Kajaanissa.